Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLIN3O60664 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLIN3O60664 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms