Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms