Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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