Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1AO15047 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms