Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms