Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms