Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIP1O00291 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIP1O00291 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIP1O00291 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIP1O00291 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIP1O00291 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIP1O00291 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIP1O00291 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIP1O00291 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIP1O00291 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms