Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QRK9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QRK9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QRK9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QRK9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QRK9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QRK9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QRK9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QRK9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QRK9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QRK9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms