Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCER2I3L3R5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms