Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PMD0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PMD0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PMD0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PMD0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
E9PMD0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PMD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PMD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PMD0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PMD0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PMD0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms