Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E9PBE3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E9PBE3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E9PBE3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
E9PBE3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E9PBE3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E9PBE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E9PBE3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E9PBE3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms