Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMIM1B2RUZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms