Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL3A8MV65 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL3A8MV65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL3A8MV65 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL3A8MV65 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms