Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms