Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL13PA6NNM8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms