Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms