Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms