Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms