Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS37CA5D8V6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms