Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB4A4D0S4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms