Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms