Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A0A1W2PQ09 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A1W2PQ09 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms