Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTU2

CTXND1, Cortexin domain-containing 1, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXND1A0A1B0GTU2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXND1A0A1B0GTU2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXND1A0A1B0GTU2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms