Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.01■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms