Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.85■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC51.84■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC51.84■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC51.84■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC51.83■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
DCAF1Q9Y4B6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC51.78■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
DCAF1Q9Y4B6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC51.74■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC51.73■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC51.73■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC51.72■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.64■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC51.63■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
DCAF1Q9Y4B6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC51.61■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC51.59■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC51.59■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
DCAF1Q9Y4B6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
DCAF1Q9Y4B6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
DCAF1Q9Y4B6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC51.44■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC51.44■■■■■ 5.83
DCAF1Q9Y4B6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC51.41■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.38■■■■■ 5.82
DCAF1Q9Y4B6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
DCAF1Q9Y4B6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC51.27■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
DCAF1Q9Y4B6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC51.24■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC51.19■■■■■ 5.79
DCAF1Q9Y4B6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC51.17■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC51.17■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC51.14■■■■■ 5.78
DCAF1Q9Y4B6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms