Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTCL1Q9Y4B5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTCL1Q9Y4B5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MTCL1Q9Y4B5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTCL1Q9Y4B5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTCL1Q9Y4B5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTCL1Q9Y4B5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms