Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIP1Q9Y3R0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIP1Q9Y3R0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIP1Q9Y3R0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIP1Q9Y3R0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIP1Q9Y3R0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms