Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPDR1Q9UM22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPDR1Q9UM22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPDR1Q9UM22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPDR1Q9UM22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EPDR1Q9UM22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EPDR1Q9UM22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EPDR1Q9UM22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EPDR1Q9UM22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms