Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PALD1Q9ULE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PALD1Q9ULE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALD1Q9ULE6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PALD1Q9ULE6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms