Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC88CQ9P219 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC88CQ9P219 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC88CQ9P219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC88CQ9P219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC88CQ9P219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms