Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM9Q9P0T7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM9Q9P0T7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM9Q9P0T7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM9Q9P0T7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM9Q9P0T7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM9Q9P0T7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms