Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO8Q9NRD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO8Q9NRD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO8Q9NRD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO8Q9NRD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO8Q9NRD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO8Q9NRD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO8Q9NRD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms