Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ6

ZC4H2, Zinc finger C4H2 domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC4H2Q9NQZ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC4H2Q9NQZ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC4H2Q9NQZ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC4H2Q9NQZ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC4H2Q9NQZ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZC4H2Q9NQZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms