Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A2Q9NQ11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A2Q9NQ11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A2Q9NQ11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A2Q9NQ11 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A2Q9NQ11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A2Q9NQ11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
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