Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLMQ9NP87 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLMQ9NP87 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLMQ9NP87 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLMQ9NP87 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLMQ9NP87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms