Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPN1Q9HCN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPN1Q9HCN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPN1Q9HCN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPN1Q9HCN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPN1Q9HCN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPN1Q9HCN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms