Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELL3Q9HB65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELL3Q9HB65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELL3Q9HB65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL3Q9HB65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELL3Q9HB65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms