Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNDIG1Q9H7V2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNDIG1Q9H7V2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNDIG1Q9H7V2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNDIG1Q9H7V2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms