Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRABDQ9H4I3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRABDQ9H4I3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRABDQ9H4I3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRABDQ9H4I3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms