Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM117Q9H0C3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMEM117Q9H0C3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM117Q9H0C3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM117Q9H0C3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM117Q9H0C3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM117Q9H0C3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms