Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASXL3Q9C0F0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ASXL3Q9C0F0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASXL3Q9C0F0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASXL3Q9C0F0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ASXL3Q9C0F0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ASXL3Q9C0F0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASXL3Q9C0F0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASXL3Q9C0F0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms