Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC8Q9BY41 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC8Q9BY41 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC8Q9BY41 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC8Q9BY41 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC8Q9BY41 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC8Q9BY41 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC8Q9BY41 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms