Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNHG12Q9BXW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNHG12Q9BXW3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNHG12Q9BXW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms