Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RNF17Q9BXT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
RNF17Q9BXT8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RNF17Q9BXT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RNF17Q9BXT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RNF17Q9BXT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RNF17Q9BXT8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RNF17Q9BXT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RNF17Q9BXT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RNF17Q9BXT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RNF17Q9BXT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
RNF17Q9BXT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RNF17Q9BXT8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RNF17Q9BXT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms