Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A23Q9BV35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A23Q9BV35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC25A23Q9BV35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A23Q9BV35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms