Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTKNQ9BST9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTKNQ9BST9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTKNQ9BST9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTKNQ9BST9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms