Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRADC1Q9BSG0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRADC1Q9BSG0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRADC1Q9BSG0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms