Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF25Q9BQ70 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF25Q9BQ70 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF25Q9BQ70 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF25Q9BQ70 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF25Q9BQ70 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF25Q9BQ70 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF25Q9BQ70 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF25Q9BQ70 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TCF25Q9BQ70 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF25Q9BQ70 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms