Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX50Q9BQ39 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX50Q9BQ39 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX50Q9BQ39 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX50Q9BQ39 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX50Q9BQ39 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX50Q9BQ39 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms