Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL7Q96S82 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL7Q96S82 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL7Q96S82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL7Q96S82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL7Q96S82 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBL7Q96S82 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBL7Q96S82 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms